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/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9410b.zip / M94A0234.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-10-08  |  3KB  |  44 lines
  1.        Document 0234
  2.  DOCN  M94A0234
  3.  TI    Sequence-selective binding to DNA of cis- and trans- butamidine
  4.        analogues of the anti-Pneumocystis carinii pneumonia drug pentamidine.
  5.  DT    9412
  6.  AU    Bailly C; Donkor IO; Gentle D; Thornalley M; Waring MJ; Department of
  7.        Pharmacology, University of Cambridge, UK.
  8.  SO    Mol Pharmacol. 1994 Aug;46(2):313-22. Unique Identifier : AIDSLINE
  9.        MED/94359494
  10.  AB    Footprinting experiments using both DNase I and methidium
  11.        propyl-EDTA.Fe(II) have been used to investigate the sequence
  12.        selectivity in binding to DNA of pentamidine and four butamidine
  13.        analogues active against the Pneumocystis carinii pathogen, which
  14.        afflicts patients with acquired immunodeficiency syndrome. In common
  15.        with pentamidine, the butamidine drugs, which contain cis- or
  16.        trans-1,4-but-2-ene linkers and either bis(amidine) or
  17.        bis(imidazolidine) terminal groups, bind selectively to DNA sequences
  18.        composed of at least 4 consecutive A.T base pairs. None of the drugs
  19.        tolerates the presence of a G.C base pair within the binding site.
  20.        Consistently in the DNase I and methidium propyl-EDTA.Fe(II)
  21.        footprinting experiments, the cis-isomers produce stronger footprints
  22.        than do the trans-isomers, despite their similar hydrogen-bonding
  23.        potentialities. The present experimental data support the view that the
  24.        conformation of the drug plays a determining role in the binding
  25.        reaction. Starting from the known structure of a
  26.        pentamidine-oligonucleotide complex, it is possible to rationalize the
  27.        different capacities of the cis- and trans-butamidine analogues to
  28.        recognize defined DNA sequences in terms of the radius of curvature of
  29.        the molecule and the distance between the positively charged terminal
  30.        groups. Together, these features constitute critical factors favoring
  31.        (cis-conformation) or hampering (trans-conformation) the fitting of the
  32.        drugs into the minor groove of DNA. In terms of structure-activity
  33.        relationships, the AT-specific recognition of DNA by this series of
  34.        butamidine derivatives cannot be directly correlated with their
  35.        potencies against Pneumocystis carinii pneumonia.
  36.  DE    Base Sequence  Binding Sites  DNA/*METABOLISM  Human  Molecular Sequence
  37.        Data  Pentamidine/*ANALOGS & DERIVATIVES/CHEMISTRY/*METABOLISM/
  38.        PHARMACOLOGY  Pneumocystis carinii/*DRUG EFFECTS  Structure-Activity
  39.        Relationship  Support, Non-U.S. Gov't  JOURNAL ARTICLE
  40.  
  41.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  42.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  43.  
  44.